-p --prune

フェッチする前にリモートに存在しなくなったリモート追跡参照を削除します。

git-fetch – Git コマンドリファレンス（日本語版）

実際に実行してみたサンプルはこちら。

$ git fetch --prune
From https://github.com/xxx
 - [deleted]         (none)     -> origin/dependabot/bundler/bullet-7.1.3
 - [deleted]         (none)     -> origin/dependabot/bundler/stringio-3.0.9

参考

• リモートで消されたブランチが手元で残ってしまう件を解消する - Qiita